pUAST Cas9発現ベクター(プロモーター選択可)

当社の pUAST Cas9発現ベクターは、非常に効率よくトランスジェニックハエが作製する上で有用で、Cas9タンパク質を発現します。本ベクターは、CRISPR遺伝子編集のためのCas9発現とP因子ベースシステム（pUAST）を組み合わせたもので、ユーザー指定のプロモーターを組み込み、長期間のユビキタス、組織特異的、あるいは誘導可能なCas9タンパク質発現を実現します。

CRISPR（clustered regularly interspaced short palindromic repeats）/Cas9システムは、様々な生物において、in vitroおよびin vivoでの遺伝子の不活性化を大幅に促進してきました。このゲノム編集システムでは、Cas9酵素はガイドRNA（gRNA）と複合体を形成し、ゲノム中の18-22ntの相同な標的配列と直接相互作用することで標的特異性をもたらします。gRNAの標的部位へのハイブリダイゼーションによってCas9が特定の位置に誘導され、ゲノム中の標的部位を切断します。Cas9はゲノムをスクリーニングし、gRNAに相補的な配列（プロトスペーサー隣接モチーフ(PAM) NGGが直後に続く場合）を切断します。二重鎖切断はその後、相同組換えまたは非相同末端結合によって修復され、その結果、様々な長さのインデル（ゲノム中への塩基の挿入または欠失）が生じます。オールインワン・ベクター（Cas9とgRNAの両方を発現する単一ベクター）、またはCas9とgRNAの発現をそれぞれ駆動するためのベクターをそれぞれ導入するだけで、ショウジョウバエでCRISPR/Cas9システムを利用することができ、ノックアウト系統を短時間で作製することができます。

pUAST システムは二つの主要なエレメント：（１）ゲノムインテグレーションに必要なP因子末端リピートと（２）ユーザーが選択するGOI （Cas9）を駆動するプロモーターから構成されています。ゲノムインテグレーションには通常2つのベクターが必要です：一つはpUASTプラスミドと呼ばれるベクターで、トランスポーズ（転移挿入）される領域／遺伝子を括る2つのP因子末端リピートを含んでいます；もう一つはヘルパープラスミドまたはトランスポゼースプラスミドと呼ばれるベクターで、Pトランスポゼースをコードしています。pUASTとトランスポゼースプラスミドを標的細胞に共注入すると、ヘルパープラスミドから産生されたトランスポゼースがpUASTプラスミド上の2つのP因子末端リピートを認識し、末端リピートを含むフランク領域を宿主ゲノムに挿入します。Pトランスポゼースは短時間しか発現せず、ヘルパープラスミドがなくなると、トランスポゾンの宿主ゲノムへの組み込みは恒久的になります。また、pUASTプラスミドをショウジョウバエのPトランスポゼース発現系統の細胞に注入することもできます。挿入は挿入部位の配列に影響されず、大きな偏りなく起こります。P-因子はクラスIIトランスポゾンであり、コピーを残すことなく場所をホッピングしながらカットアンドペーストで移動します（対照的にクラスIトランスポゾンはコピーアンドペーストで移動します）。

このpUAST Cas9発現ベクターは、実験目的に応じて、使用したいプロモーターの配列を入力（貼り付ける）か、当社のショウジョウバエプロモーターデータベースから選択したプロモーターを使用することができます。アクチン5C、ポリユビキチン、α-1チューブリンなどのユビキタスプロモーター、ショウジョウバエの眼球に特異的にGOIを発現させるRh2などの組織特異的プロモーター、Cu+の存在下や熱ショックに応答して発現させるMtnやDmHsp70などの誘導性プロモーターから選択できます。さらに、pUASTベクター上のミニホワイト遺伝子は目の色をコードし、導入遺伝子の組換えに成功したトランスジェニックハエを同定するためのマーカーとして使われます。PCRやその他の分子生物学的手法も、トランスジェニック細胞や動物の同定に用いることができます。

ベクターシステムの詳細については、下記の文献をご参照ください。

当社のpUASTB　Cas9発現ベクターは、効率的なPトランスポゼース媒介のCas9 遺伝子挿入を達成できるように設計されています。当社のベクターは、大腸菌での高コピー数複製とショウジョウバエ系統の高効率トランスジェネシスに最適化されています。本ベクターはユーザー指定のプロモーターを使用でき、ユーザーはCas9遺伝子発現を駆動するためにユビキタス、組織特異的、または誘導性プロモーターを選択できます。

柔軟性（選択の幅がある）: pUASTベクター（プロモーター選択可）は、ユーザーが実験目的に応じてGOIを駆動するためのユビキタス、組織特異的または誘導性プロモーターを選択することを可能にしています。

ゲノムにランダムに挿入される: P-因子のランダムな挿入は、挿入部位のマッピングを困難にし、ゲノム上の位置が導入遺伝子の発現に影響を与える可能性があります。さらに、導入遺伝子がゲノム内の遺伝子や調節エレメントに挿入されると、内在性遺伝子に影響を与える可能性があります。

効率は中程度: P因子ベクターを用いた生殖細胞系列への導入は、pUASTattBのようなφC31インテグラーゼを介したシステムよりも一般的に効率が低いです。.

技術的な煩雑さ: トランスジェニックハエの作製は胚へのインジェクションやハエの飼育・交配など、高い技術が要求されます。

P-element 3’ end: P因子の右側TR（terminal repeat）もしくは3’TR。DNA配列がP因子5‘TRと3‘TRで挟まれている場合、Pトランスポゼースは両TRに挟まれている領域を宿主ゲノムに挿入する。

Promoter: 下流の遺伝子の発現させるためのプロモーターが配置される。

Kozak: Kozak配列。真核生物での翻訳開始を促進すると考えられているためORFの開始コドンの前に配置される。

Cas9: Cas9ヌクレアーゼ（CRISPR-associated endonuclease）、gRNAによって局在した個所でDNAを切断する。

SV40 terminator:  SV40（Simian virus 40）のポリアデニレーションシグナル。上流ORFの転写停止を助ける。

mini-white: ショウジョウバエのwhite遺伝子の派生型。ミニホワイト遺伝子は成体ショウジョウバエの目の色に関する優性マーカーであり、white遺伝子変異体をバックグラウンドとした遺伝子導入の成否の判断に使用する。

P-element 5’ end: P因子の左側TR（terminal repeat）もしくは5’TR。DNA配列がP因子5‘TRと3‘TRで挟まれている場合、Pトランスポゼースは両TRに挟まれている領域を宿主ゲノムに挿入する。

pUC ori:  pUC複製起点。E.coliでプラスミドを高コピーで維持する。

Ampicillin: アンピシリン耐性遺伝子。E.coliへのアンピシリン耐性によるプラスミドの維持を可能にする。